ترکیب باکتری‌های اپی فیت برگ چغندرقند در مناطق مهم چغندرکاری غرب کشور
عنوان دوره: بیست و دومین کنگره گیاهپزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
باکتری‌های اپی‌فیت به باکتری‌هایی گفته می‌شود که در سطح گیاه زندگی می‌کنند. این باکتری‌ها، در سطح اپیدرم برگ و آپوپلاست سلول‌های مزوفیل وجود دارند، اما در داخل سلول‌ها و یا بافت‌ها گیاهی یافت نمی‌شوند. در شرایط طبیعی، گونه‌های مختلف گیاهی جمعیت‌های متفاوتی از باکتری‌های اپی‌فیت را در خود جای می‌دهند. گیاهان باکتری‌های اپی‌فیت را تحت شرایط تنش به کار گرفته و این باکتری‌ها نقش مهمی در دفاع گیاهان و سایر انواع تنش ایفا می‌کنند. همچنین، اکثر باکتری‌های بیماری‌زای گیاهی، قبل از ایجاد بیماری در سطح گیاهان به‌عنوان باکتری‌های اپی‌فیت، سطح برگ را کلنیزه می‌کنند. جهت تعیین باکتری‌های اپی‌فیت برگ گیاه چغندرقند، در طول فصل زراعی سال 1393 از مناطق مهم چغندرکاری غرب کشور بازدید به‌عمل‌آمده و تعداد 23 گیاه شاداب و قوی چغندرقند از 12 منطقه به‌صورت تصادفی و با حرکت در قطرهای مزرعه انتخاب شد. جهت جداسازی باکتری‌های اپی‌فیت قطعاتی از سطح برگ چغندرقند در محلول آب استریل حاوی 1% ژلاتین قرار داده و پس از گذشت زمان 30 الی 45 دقیقه سوسپانسیون حاوی باکتری را در محیط آگار مغذی دارای 3 گرم در لیتر عصاره مخمر کشت و در دمای 25 درجه سانتی‌گراد قرار داده شد. پس از رشد کلنی‌های باکتریایی برحسب شکل ظاهری و رنگ کلنی از هر نمونه در هر پتری دیش تعداد 2 تا 3 کلنی انتخاب و روی محیط کشت مزبور خالص شدند. درمجموع تعداد 70 جدایه باکتری از سطح برگ گیاه چغندرقند جداسازی گردید. برای انتخاب نماینده استرین‌های باکتریایی ابتدا پروتئین‌های محلول سلولی استخراج و به روش ناپیوسته لاملی الکتروفورز شدند. درمجموع، 17 الکتروتیپ مختلف پروتئینی به این روش شناسایی شد. تعداد دو عدد از این الکتروتیپ‌ها (11 درصد کل الکتروتیپ‌ها) وقوع بالایی داشته و یک نماینده از هر الکتروتیپ انتخاب و با روش‌های استاندارد باکتری‌شناسی ویژگی‌های فنوتیپی آن‌ها تا حد شناسایی گونه بررسی شد. همچنین ژن‌های کد کننده 16S rRNA نماینده‌های هر یک از سه گروه با روش آزمون PCR با استفاده از آغازگرهای fD1 و rD1 فراوان سازی و پس از توالی یابی، با بانک داده‌های موجود در سایت NCBI با نرم‌افزار بلاست آنالیز و مقایسه شدند و با فراوانی 35 و 17 استرین به ترتیب به‌عنوان گونه‌های Bacillus simplex و Stenotrophomonas maltophilia شناسایی شدند. سایر الکتروتیپ‌ها وقوع پایین‌تری داشته و ویژگی فنوتیپی آن‌ها تا سطح جنس با استفاده از روش‌های استاندارد باکتری‌شناسی بررسی شد و این الکتروتیپ‌ها با فراوانی 8، 6 و 4 استرین به ترتیب به‌عنوان جنس‌های sp Streptomyces، sp Enterobacter و sp Aeromonas شناسایی شدند. این اولین گزارش از وجود باکتری‌های اپی‌فیت برگ چغندرقند در مناطق عمده چغندرکاری غرب کشور است.
کلیدواژه ها