تعیین توالی بخشی از ناحیه ITS-rDNA و تجزیه و تحلیل مقدماتی فیلوژنتیکی جدایه‌های کلادوسپوریوم در شمال ایران

عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران

گونه‌های کلادوسپوریوم به طور مکرر از مناطق مختلف ایران جداسازی شده‌اند. این مطالعه به منظور شناسایی مولکولی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه‌های آن انجام شده است. در این بررسی 17 جدایه از گونه مرکب C. cladosporioides، سه جدایه از گونه C. sphaerospermum و دو جدایه شبه-کلادوسپوریوم Chalastospora gossypii مورد بررسی قرار گرفت. DNA کل از میسلیوم و به روش Chelex استخراج و با جفت آغازگرهای ITS1، ITS5 و ITS4 تکثیر شد. توالی ناحیه rDNA ITS (شامل 5.8S) 29 جدایه به همراه شش توالی‌ به دست آمده از بانک ژن با دو روش تلفیق همسایه‌ها (Neighbor-Joining) و حداقل تکامل (Minimum-Evolution) با استفاده از نرم افزار MEGA 5.0 مورد تجزیه تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفت. نتایج اولیه نشان داد، در هر دو روش جدایه‌های مرتبط با گونه مرکب C. cladosporioides در یک کلاد و جدایه‌های گونه C. sphaerospermum در کلاد دیگر قرار گرفتند. بر اساس همین نتایج مشخص شد، ناحیه ژنی rDNA ITS قابلیت تفکیک گونه‌های نزدیک و یا نهفته در گونه مرکب C. cladosporioides را ندارد. این بررسی با توالی یابی ناحیه ژنی TEF ادامه دارد.

تاکسونومی؛ تبار شناسی؛ توالی‌یابی؛ گونه مرکب